根据教育部科学技术司《关于公布第三届中国高校科技期刊评比结果的通知》（教技司[2010]356号），《南京中医药大学学报》编辑部获得2010年第三届中国高校优秀科技期刊奖。学报将依托学校的学术优势，进一步提高办刊水平，扩大社会影响，为促进中医药学术发展与创新做出新贡献。